Le grand public connaît surtout la plus ancienne des écoles sous tutelle de la DGAFP, c’est-à-dire l’Ena (Ecole nationale d’administration). Depuis son installation à Strasbourg en 2002, l’Ena a fusionné avec l’IIAP (Institut interrégional d’administration publique) puis avec le Centre des études européennes de Strasbourg (CEES) qui prépare aux concours administratifs européens et est devenu le pôle européen de l’Ena.
L’Ena cultive des partenariats avec nombre de grandes institutions ou universités européennes : la London School of Economy (LES), l’Ecole de la haute administration allemande, les Universités européennes de Florence et La Sapienza , à Rome, l’Institut européen d’administration de Maastricht, le National College à Londres etc. Avec l’Université de Postdam et deux universités berlinoises - la Humbolt et la Freie Universität - elle a créé un mastère européen de gouvernance et d’administration publique bilingue.
Depuis mars 2004, le concours d’entrée est ouvert aux ressortissants de l’Union européenne.
Outre l’Ena, la DGAFP assure aussi la tutelle des cinq Instituts régionaux d’administration (IRA), situés à Lille, Metz, Nantes, Lyon et Bastia.